中年以上妇女，皮肤明显瘙痒、肝大、黄瘤。血清总胆固醇明显增高，血清胆红素轻、中度升高，碱性磷酸酶增高，胆酸浓度增加。IgM升高，抗线粒体抗体阳性且滴度高。如能穿刺取得组织学证据，则更有助于确诊胆汁性肝硬化。

胆汁性肝硬化的鉴别诊断：包括梗阻性黄疸，如胆总管结石、胆总管瘤、胰头及胆管狭窄等，主要鉴别方法为胆道造影。应与下列疾病鉴别：

慢性活动性肝炎：凡抗线粒体抗体阳性，伴有胆淤及组织学上有胆管异常者，应首先除外慢性活动性肝炎，国内慢性活动性肝炎胆淤型较原发性胆汁性肝硬化多见，短期皮质激素治疗的效果观察有助于鉴别。

硬化性胆管炎：此病少见，主要累及大胆管，上述免疫标记物阴性，且多有细菌感染性发热，胆管系统造影可帮助鉴别。

药物引起的黄疸：如氯丙嗪、甲基睾丸酮、磺胺、砷制剂等。多由个体过敏引起，有服药史，在服药后数周之内发病，黄疸可持续数年，常伴血嗜酸细胞增高，肝活检没有典型的原发性胆汁性肝硬化组织学表现。