肝移植术前可能有包括肝肾综合征在内的肾功能不全，术后肾功能不全发病率也较高。对肾功能的影响因素包括：与终末期肝病有关的肾功能不良，复杂的肝移植手术，术后肝功能状态差，抗排斥和抗感染使用的肾毒性药物以及感染等并发症。其中术中主要因素是血液动力学的重大改变导致的肾脏低灌注损伤或肾脏淤血。术后的最常见的损伤因素是环孢霉素A的肾毒性作用。

术后药物康复

术后维持足够的血容量、精确控制液体量、密切监测环孢霉素A的血药浓度、选用无肾毒性或肾毒性小的抗生素和抗真菌药物，对避免环孢霉素A造成的肾功能损害有很大作用。另外小剂量多巴胺(1-2mg/kg.min)及前列腺素E1的应用有保护肾功能的作用。

对于术后早期肾功能衰竭的患者，血液动力学还不稳定，尽量不使用透析而是较温和的方法来去除病人体内液体及有毒物质的积聚，如持续动静脉血液滤过，持续静脉-静脉血液滤过。

对于术前有严重肾功能不全和病理学证实的肾脏损害应考虑肝肾联合移植。这是一种较成功的手术方式，但必须严格局限在肾功能不全为不可逆转的患者，且不适用于肝肾综合征和急性肾小管坏死的病人。